Картирование генома-метод, направлен на изуч-е структуры генома на основании частот рекомбинации(кроссинговер), локализац генов в хр-омах, их длине и расстоянии между ними, + их полной нуклеотидной последовательности. Генетическая карта-упорядоченная система эл-ов генома, в основу которой положена хр-омная принадлежность и взаимное расположение генов в пределах отдельных хр-ом. Основным методом построения карт генов является классический генетический анализ или анализ наследования признаков в родословных. При локализации генов в одной хромосоме они чаще всего вместе попадают от родителя в половую клетку. В разных половых клетках родительские аллели оказываются, если между ними генами проходит кроссинговер. Его частота является мерой расстояния между генами, исчисляемая в сантиморганах.
Ген карты:
а)Кары сцепления- схема располож-я генов, находящиеся в 1 гр сцепления, за единицу расстояния принята морганида, отражающая частоту кроссинговера. Вначале важно отнесение исследуемого гена к конкретной гр сцепления(Уилсон 1911г отнес ген дальтонизма к Х-хр-ме)(проводят скрещивания между мутантными особями 2ух разных генетических линий и определяют, насколько независимо комбинируют признаки в поколениях=сцеплены ли соответствующие гены). Далее-определяют порядок расположения генов в хр-ме и расстояния между ними (стало возможно после открытия кроссинговера). Эти карты отражают порядок располож-я генетических маркеров,но полученные расстояния не соответствуют реальным(из-за различий эффективности рекомбинации м\у хроматидами на отдельных уч хр-ом).
б)Цитогенетические карты хр-ом-схематич изображ-е хр-ом с указанием мест фактического размещения отдельных генов(локусов-область локализации эл-ов генома), полученное использованием цитогенетических(с помощью микроскопа) методов. Каждый локус на генетич карте, установленный по карте сцепления, на цитогенетич картах привязан к определенному уч хр-омы(что служит одним из доказательств хр-омной т наследственности). Эти карты строятся на анализе хр-омных перестроек(делеции,вставки и тп), сопоставляя изменения морфологич признаков хр-ом с изменениями генетич св-в орг. Но и тут физич расстояние не соответствует генетическому(поэтому плотность гаспредел-я генов на цитогенетич и генетич картах различна). Из-за неравномерности частот перекеста по длине хо-омы. Современные карты онованы на дифференциальном окрашивании хр-ом(в Х-хр-ме картировано 400 генов,на 1ой хр-ме 200)каждый картированный ген=молекулярный маркер.
в)Рестрикционные карты- основаны на действии рестриктаз(ферментов,разрушающих днк в строго специфичных последовательностях). Они позволяют превращать молекулы ДНК в набор фрагментов длиной от нескольких сотен до нескольких тысяч оснований. Но длина генома живых организмав гораздо больше(кишечн палочка-6млн пар оснований; работает для вирусов).это не позволяет детализировать структуру отдельных генов.
г)Сиквенсовые карты-основана на прямом анализе днк и не зависит от частоты рекомбинаций, названа физической картой. Это карты высокого разрешения(1 нуклеотид), что облегчает выделение многочисленных генетических маркеров. Отражают реальное расстояние м\у маркерами, выражаемое в парах оснований.
|